衢州市在完成国有企业改制的基础上，又逐步开始了事业单位的改制，在改制、安置过程中，必然要涉及到许多历史遗留问题，也必然要从档案中解决这些问题，为此，市档案馆积极配合全市事业单位改制工作，以优质、高效的服务为改制工作作贡献。作为第一批改制对象的市皮肤病性病医院(原市皮肤病防治站)，在改制过程中涉及到房产、审计及职工安置时工龄计算、职称确定等，都数次到市档案馆查找，最终都得以圆满解决，而供销社、粮食局、市政府等下属的事业单位改制中遇到的问题也先后在市档案馆得到解决。